服务案例

公司与复旦大学合作，开发“高通量功能蛋白质组学虚拟仿真实验”课程。

项目简介

蛋白质组学的研究是分析化学的研究前沿和热点问题。在过去的二十多年里，利用多种蛋白质酶解、富集、分离和分析鉴定技术对影响人类健康的重大疾病如肝癌、胃癌、肠癌等的生物样本进行研究，同时也发展和建立了蛋白质酶解、富集、分离、分析鉴定等新技术。

在蛋白质组学研究中，高效液相色谱和质谱联用（HPLC-MS）技术是常用和重要的支撑工具之一。但由于生物质谱仪器价格昂贵、运行成本高，使得该类实验在本科生实验教学中难以大范围展开。本实验拟构建一个HPLC-MS联用技术鉴定蛋白质的虚拟仿真实验平台。利用该平台，学生可以进行虚拟的蛋白质酶解、富集、分离和鉴定实验。实验过程中可以设置不同的实验参数达到改变实验条件的作用，并获得不同的实验结果。通过对实验结果的分析和评价，选择最优化的实验条件，达到最佳的分析结果。

实验内容

实验分为四个模块

模块一：蛋白质酶解，

利用胰蛋白酶对蛋白质进行酶解得到分子量较小的肽段。

还原烷基化

模块二：多肽富集

利用C18修饰的纳米材料可以选择性的吸附肽段，从而将多肽与强极性的小分子和无机盐进行分离，实现具有磷酸化后修饰的多肽富集。

放进细胞培养箱，孵育

模块三：多肽HPLC分离

利用反相色谱原理对多肽进行分离，固定相为C18修饰的色谱柱。

设置梯度洗脱参数

模块四：多肽MS鉴定

利用串联质谱作为LC的检测器，对每个馏分中的多肽的精确分子量和特征碎片质量进行测定，综合多肽的精确分子量和碎片信息，实现多肽的结构分析。

多肽鉴定